Ich verstehe dein Problem nicht so richtig.
Du nimmst ein Blatt Papier, oder in PS eine neue Leinwand mit der Größe 210x297mm was A4 entspricht. Würde eine Auflösung von min. 300px wählen, gern auch drüber.
Dann teilst du deine Seite mit Paneln ein, wie du es beschrieben hast.
In diese Panel zeichne dein Layout und zeig es uns, zwolefant ist super im Layout, was extrem wichtig für die Lesbarkeit eines Comics ist.
Du brachst keine Website, ein Blog bei z.B. Wordpress reicht.
Klick mal in meinen Link von FeeryTales, da siehst du das.